上海交大洪亮团队研发Venus模型，AI设计蛋白质助力产业

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上海交通大学洪亮教授团队近日亮相央视新闻频道特别策划节目《科技引擎》，向观众展示了他们自主研发的蛋白质功能设计Venus系列模型。该团队创建了全球规模最大的蛋白质数据库Venus-Pod，涵盖了近九十亿条序列以及数亿个功能标签，几乎覆盖了自然界中的所有蛋白质资源。

据洪亮教授透露，Venus系列模型通过对海量蛋白质的氨基酸序列构成模式及其关联功能标签的学习，能够准确辨识不同功能蛋白质的特点，比如抗强碱性和耐高温性等属性。当遇到普通蛋白质缺少某些特定功能的情况时，模型可以为其增添相关特性，从而实现对蛋白质功能的精确设计。

Venus系列模型拥有两大关键能力：一是“AI探针”，能够在海量蛋白质序列信息中寻找满足特定功能需求的潜在蛋白，例如具备耐胃酸、耐高温等特殊性能的超级蛋白；二是“AI定制进化”，可针对现有蛋白质实施性能改进与优化，例如提升稳定性、强化活性等，这些改良后的蛋白质在生物制造、医药开发、工业生产等多个领域展现出巨大的实用价值。

截至目前，Venus已服务于国内外近30家生物/医药公司，完成了30多种蛋白的改造与优化工作，其中8种产品已经实现了商业化生产。举例来说，一种在强碱环境下容易失效的抗体，经过AI技术处理后，其稳定性提升了4倍，每年为企业节省了上千万元的成本；另外一款用于急性胰腺炎检测的酶，优化后仅需国际同类产品成本的十分之一，并且实现了1000公斤级别的量产。

Venus-Pod数据库的一大亮点是，除了常规生物体内的蛋白质序列外，还收录了来自马里亚纳海沟、火山口等极端环境下的耐高温、耐高压、耐强酸/强碱的蛋白质样本。这样的综合性数据库为Venus模型提供了丰富的“工具库”，使其能够迅速有效地完成蛋白质的优化改造任务，以适应各种行业的需求，为生物技术行业注入了创新活力。

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