由于从Google Buckets和FTP下载GATK Resource Bundle变得不便，目前只能通过Azure进行下载。本文详细介绍了如何从Azure下载GATK Resource Bundle的步骤，包括资源地址的获取和azcopy工具的使用。通过访问GATK官网和Azure相关页面，可以找到五种不同资源的下载地址，并通过azcopy工具实现高效下载。

由于众所周知的原因，从Google Buckets下载GATK Resource Bundle并不容易，而FTP下载方式自2020年起已关闭，目前只剩下通过Azure下载这一种方法。以下是如何从Azure下载GATK Resource Bundle的详细步骤。

根据GATK官网关于Resource bundle的说明（https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360035890811-Resource-bundle），Azure中的GATK Resource Bundle资源地址可以在GATK Resource Bundle（https://learn.microsoft.com/en-us/azure/open-datasets/dataset-gatk-resource-bundle）中找到。重点关注的是各种Resource bundle的Data Access地址：

datasetgatkbestpractices
West US 2: 'https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset'
West Central US: 'https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS Token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=6SaDfKtXAIfdpO%2BkvNA%2FsTNmNij%2Byh%2F%2F%2Bf98WAUqs7I%3D
datasetgatklegacybundles
West US 2: 'https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset'
West Central US: 'https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS Token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=xBfxOPBqHKUCszzwbNCBYF0k9osTQjKnZbEjXCW7gU0%3D
datasetgatktestdata
West US 2: 'https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset'
West Central US: 'https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS Token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=fzLts1Q2vKjuvR7g50vE4HteEHBxTcJbNvf%2FZCeDMO4%3D
datasetpublicbroadref
West US 2: 'https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset'
West Central US: 'https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS Token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=DQxmjB4D1lAfOW9AxIWbXwZx6ksbwjlNkixw597JnvQ%3D
datasetbroadpublic
West US 2: 'https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset'
West Central US: 'https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset'
SAS Token: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=u%2Bg2Ab7WKZEGiAkwlj6nKiEeZ5wdoJb10Az7uUwis%2Fg%3D

可以看到共有5种资源可供下载，他们的具体解释可参见GATK resource bundle官网。每一种资源有两个服务器地址，分别是West US 2地址和West Central US地址，同时还给出了token值，只需将两者合并在一起即可得到一个合法的Azure资源地址。

为了从Azure下载数据，需要使用azcopy工具。azcopy的安装与使用详情见（https://learn.microsoft.com/en-us/azure/storage/common/storage-use-azcopy-v10）。以下以Linux版本的azcopy为例，下载datasetgatklegacybundles资源。

首先，下载并安装azcopy：

wget https://aka.ms/downloadazcopy-v10-linux
mv downloadazcopy-v10-linux az-copy.tar
tar -xvf az-copy.tar
将azcopy添加到PATH中
echo 'export PATH=$PATH:you_azcopy_path' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

接下来，将datasetgatklegacybundles的资源地址拼接好：

# West US 2
gatklegacybundles_http_1='https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=xBfxOPBqHKUCszzwbNCBYF0k9osTQjKnZbEjXCW7gU0%3D'
West Central US
gatklegacybundles_http_2='https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=xBfxOPBqHKUCszzwbNCBYF0k9osTQjKnZbEjXCW7gU0%3D'

然后，使用azcopy下载资源：

# azcopy copy [source] [destination] [flags]
azcopy copy $gatklegacybundles_http_1 gatklegacybundles --recursive

由于这是文件夹下载，记得要加上--recursive参数，然后就可以等待资源下载就绪了。

好了，本文到此结束，带大家了解了《GATK资源包下载攻略及详细教程》，希望本文对你有所帮助！关注golang学习网公众号，给大家分享更多文章知识！