Arrow CSV 读取器在同一文件上返回多个 null 值
在IT行业这个发展更新速度很快的行业,只有不停止的学习,才不会被行业所淘汰。如果你是Golang学习者,那么本文《Arrow CSV 读取器在同一文件上返回多个 null 值》就很适合你!本篇内容主要包括##content_title##,希望对大家的知识积累有所帮助,助力实战开发!
我正在尝试使用多个 goroutine 读取同一个文件,其中每个 goroutine 都分配了一个字节来开始读取,并分配了一些行来读取 linelimit。
通过将 csv.chunksize 选项设置为 chunksize 变量,当文件适合内存时,我成功地做到了这一点。但是,当文件大于内存时,我需要减少 csv.chunksize 选项。我正在尝试这样的事情
package main
import (
"io"
"log"
"os"
"sync"
"github.com/apache/arrow/go/v11/arrow"
"github.com/apache/arrow/go/v11/arrow/csv"
)
// A reader to read lines from the file starting from the byteOffset. The number
// of lines is specified by linesLimit.
func produce(
id int,
ch chan<- arrow.Record,
byteOffset int64,
linesLimit int64,
filename string,
wg *sync.WaitGroup,
) {
defer wg.Done()
fd, _ := os.Open(filename)
fd.Seek(byteOffset, io.SeekStart)
var remainder int64 = linesLimit % 10
limit := linesLimit - remainder
chunkSize := limit / 10
reader := csv.NewInferringReader(fd,
csv.WithChunk(int(chunkSize)),
csv.WithNullReader(true, ""),
csv.WithComma(','),
csv.WithHeader(true),
csv.WithColumnTypes(map[string]arrow.DataType{
"Start_Time": arrow.FixedWidthTypes.Timestamp_ns,
"End_Time": arrow.FixedWidthTypes.Timestamp_ns,
"Weather_Timestamp": arrow.FixedWidthTypes.Timestamp_ns,
}))
reader.Retain()
defer reader.Release()
var count int64
for reader.Next() {
rec := reader.Record()
rec.Retain() // released at the other end of the channel
ch <- rec
count += rec.NumRows()
if count == limit {
if remainder != 0 {
flush(id, ch, fd, remainder)
}
break
} else if count > limit {
log.Panicf("Reader %d read more than it should, expected=%d, read=%d", id, linesLimit, count)
}
}
if reader.Err() != nil {
log.Panicf("error: %s in line %d,%d", reader.Err().Error(), count, id)
}
}
func flush(id int,
ch chan<- arrow.Record,
fd *os.File,
limit int64,
) {
reader := csv.NewInferringReader(fd,
csv.WithChunk(int(limit)),
csv.WithNullReader(true, ""),
csv.WithComma(','),
csv.WithHeader(false),
)
reader.Retain()
defer reader.Release()
record := reader.Record()
record.Retain() // nil pointer dereference error here
ch <- record
}
我尝试了之前代码的多个版本,包括:
- 复制文件描述符
- 复制文件描述符的偏移量,打开同一个文件 并寻求这种抵消。
- 在调用
flush或关闭第一个fd之前关闭第一个读取器。
无论我如何更改代码,错误似乎都是相同的。请注意,对 flush 的阅读器的任何调用都会引发错误。包括reader.next和reader.err()。
我使用 csv 阅读器是否错误?这是重复使用同一文件的问题吗?
编辑:我不知道这是否有帮助,但是在没有任何 seek 的 flush 中打开一个新的 fd 可以避免该错误(不知何故,任何 seek 都会导致出现原始错误)。但是,如果没有 seek,代码就不正确(即删除 seek 会导致任何 goroutine 根本无法读取文件的一部分)。
正确答案
主要问题是,csv阅读器在下面使用了bufio.reader,其默认缓冲区大小为4096。这意味着reader.next()将读取比需要更多的字节,并缓存额外的字节。如果在 reader.next() 之后直接从文件中读取,将会错过缓存的字节。
下面的演示展示了这种行为:
package main
import (
"bytes"
"fmt"
"io"
"os"
"github.com/apache/arrow/go/v11/arrow"
"github.com/apache/arrow/go/v11/arrow/csv"
)
func main() {
// Create a two-column csv file with this content (the second column has 1024 bytes):
// 0,000000....
// 1,111111....
// 2,222222....
// 3,333333....
temp := createTempFile()
schema := arrow.NewSchema(
[]arrow.Field{
{Name: "i64", Type: arrow.PrimitiveTypes.Int64},
{Name: "str", Type: arrow.BinaryTypes.String},
},
nil,
)
r := csv.NewReader(
temp, schema,
csv.WithComma(','),
csv.WithChunk(3),
)
defer r.Release()
r.Next()
// To check what's left after the first chunk is read.
// If the reader stop at the end of the chunk, the content left will be:
// 3,333333....
// But in fact, the content left is:
// 33333333333
buf, err := io.ReadAll(temp)
if err != nil {
panic(err)
}
fmt.Printf("%s\n", buf)
}
func createTempFile() *os.File {
temp, err := os.CreateTemp("", "test*.csv")
if err != nil {
panic(err)
}
for i := 0; i < 4; i++ {
fmt.Fprintf(temp, "%d,", i)
if _, err := temp.Write(bytes.Repeat([]byte{byte('0' + i)}, 1024)); err != nil {
panic(err)
}
if _, err := temp.Write([]byte("\n")); err != nil {
panic(err)
}
}
if _, err := temp.Seek(0, io.SeekStart); err != nil {
panic(err)
}
return temp
}
第二个读取器的目的似乎是防止它读取另一个 csv 数据块。如果您提前知道下一个 csv 数据块的偏移量,则可以将文件包装在 io.sectionreader 中,使其仅读取当前的 csv 数据块。当前的问题没有提供有关这部分的足够信息,也许我们应该将其留给另一个问题。
注释:
fd, _ := os.open(filename): 永远不要忽略错误。至少记录它们。fd大多数时候表示文件描述符。不要将其用于*os.file类型的变量,尤其是当*os.file有一个方法fd时。
终于介绍完啦!小伙伴们,这篇关于《Arrow CSV 读取器在同一文件上返回多个 null 值》的介绍应该让你收获多多了吧!欢迎大家收藏或分享给更多需要学习的朋友吧~golang学习网公众号也会发布Golang相关知识,快来关注吧!
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