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研发魔术:借力AI寻找“新药宇宙”虫洞

来源:搜狐 2023-08-07 09:24:12 0浏览 收藏

哈喽!今天心血来潮给大家带来了《研发魔术:借力AI寻找“新药宇宙”虫洞》,想必大家应该对科技周边都不陌生吧,那么阅读本文就都不会很困难,以下内容主要涉及到,若是你正在学习科技周边,千万别错过这篇文章~希望能帮助到你!

研发魔术:借力AI寻找“新药宇宙”虫洞

宇道生物正试图用崭新的“制药方法论”批量化开发药物。(受访者供图)

人工智能(AI)正在大幅增强人类对抗疾病的能力。在上海,新涌现的多家创业公司在AI助力下,瞄准最难啃的硬骨头,尝试新靶点、创造新分子。在这个新兴领域里,相关团队正在以最小的规模、最快的速度和最高的成功率追求最佳的成果,这值得关注。可以说,创新带来的爆发力尽显无疑。

“宇宙元素”取名的背后

AI制药的创新爆发力,在于它能以超常规的方式和效率,做到人所做不到的事。

AI药企新锐星药科技的创始人兼CEO李成涛很喜欢讲述一个关于科学家、药物和宇宙的故事:传统新药研发就像大海捞针,针对靶点,从海量分子中层层筛选,直到找出最合适的做成药物。尽管人类已经成功合成了数十亿种分子,但真正获批的原创小分子药物种类仅上千种。在理论上,可能存在的成药化合物数量可能高达10的60次方,这意味着数字1后面有60个零。与之相比,人类曾经做过的尝试,比沧海一粟更微不足道,唯有置于广袤的宇宙背景下,想象一粒沙子之于整个星系。

可以说,人类有待探索的新药空间几近无限,但方法却必须改变。The English name of Star Pharmaceuticals, Galixir, is derived from "Galaxy" and "Elixir", combining the concept of the universe and a universal remedy.。李成涛的初衷是借助人工智能的力量来探索广阔的化合物"宇宙",并通过发现其中能治愈疾病的微小亮点。

成立4年来,星药科技不断创新算法,让AI在“通读”生物与化学大数据之后,可以从中提炼出蛋白质、药物和疾病之间的连接。AI可以跳过实验室,直接算出分子与靶点的结合能力;它还可以超越人类的思维,直接设计出那些从未合成过、甚至从未想象到的分子,这更是传统方法无法企及的。星药科技在一项项目中,利用他们自己研发的AI模型,生成了上千万种虚拟化合物,以应对一种自身免疫性疾病的靶点。紧接着,在一个短短的月份里,通过计算机仔细检查每种成药特性,我们选择了3个分子。而后,AI继续围绕分子结构进一步“打磨”,经过80多个分子的迭代,最终顺利提名能用于临床试验的候选化合物。

有意思的是,另一家代表性AI药企——上海宇道生物技术有限公司,其英文名Nutshell(果壳)也带有满满的宇宙元素。沈倩诚,联合创始人兼董事长兼CEO,向记者表示,该名字是受到物理学家霍金的著作《果壳中的宇宙》的启发而取的。这本名著探讨了宇宙的起源和黑洞,并提出了人类或许可以利用虫洞这种时空通道来进行星际旅行。而宇道生物的梦想,就是用AI找出药物靶点中的调控“虫洞”。

15%的蛋白质靶点在人类蛋白质组中相对较容易形成药物,但却贡献了超过95%的药物。由于几乎摘完了这些“容易摘的桃子”,科学家不得不将注意力转向研究那些难以攻克的药物靶点。根据研究发现,难以成为药物靶点的变构位点具有一种类似于“虫洞”的特殊效应,可以利用这一特性来开发新药。过去,挖“虫洞”大多是碰运气,但AI展现出了洞悉“虫洞”奥妙的潜力,从而让开发变构药物从早年的盲目探索变得理性。目前,宇道生物开发的“AI+物理学”平台,可以深入挖掘蛋白结构的运动规律,其预测隐藏变构位点的成功率接近80%。

十年磨一剑,水到渠成

目前,AI制药已经在上海、在张江出现集聚爆发态势,而这其实是十年磨一剑、水到渠成的结果。

针对难成药靶点的变构药物开发,是当前新药研发的前沿之一。但是,宇道生物核心团队已在此领域默默深耕十多年。从2009年起,宇道生物创始人已经开始在该领域从事研究,至今已发表100多篇相关论文。他们同时推出了世界上第一个并且目前最大的变构数据中心,该中心目前仍然为许多科研机构和企业的研究提供支持。一旦成立公司,他们还独家开发了多种用于变构药物研发的专有算法,同时推进多个变构药物项目。可以说,无论学术研究还是成果转化,宇道生物都站在了高点。

星药科技同样有着充分的技术自信。李成涛从清华大学清华学堂计算机科学实验班(“姚班”)毕业后赴美,获麻省理工学院博士学位,并在顶级学术会议上发表过10多篇论文,是AI制药顶尖学者之一。在2019年,他回国创业并率领团队成功研发了多个世界领先的AI药物模型。

从做顶尖研究,到做顶尖企业,之间还需要一个契机。沈倩诚说,当年起步时,国内创新氛围与现在相去甚远,外界并不相信中国企业可以在技术前沿拿到首创成果,资本也不愿投入。但2016年前后,随着国家政策的带动,原创新药研发获得前所未有的支持,宇道生物在2018年拿到天使投资,之后又连续完成多轮融资。

CPU般极度精简的团队

AI驱动下,叠加张江药谷强大的创新配套能力,以及上海悉心打造的算力基础服务,AI制药领域的创业公司,能以异常精简的规模,集聚起强大能量,去追逐远大目标。

星药科技在上海、北京、深圳都有布点,但加起来仅数十人。宇道生物集中在浦东张江,所有员工不足60人。但在产出上,两家公司都已在多条管线完成布局,体现出强大能量。究其原因,一方面是因为AI本身的高效,可以节省大量人力,另一方面,新药研发的非核心环节,比如生物和化学实验,AI药企能以外包方式交给各类研发服务商。即使是算法训练和计算模拟环节,也可以不用自己建机房、养团队——目前,宇道生物的算力绝大部分来自公有云平台,在国内他们也是药物研发领域最大的云计算用户之一。

整体上,按沈倩诚所说,精简的团队就像是电脑的CPU(中央处理器)芯片,只专注于最核心环节,解决最困难问题,基于十年磨一剑打造的技术和算法,以极小的“体积”和“功耗”,输出强大的能力。

事实上,技术模式的变化也带来产业模式之变。李成涛表示,星药科技已形成以AI为核心、以科技为驱动的药物发现能力闭环,大幅提高新药研发最艰涩的临床前环节的成功率,使得研发时间从过去的4年至5年缩短到目前的1年至1年半,研发成本也更可控。由于AI让制药的系统性风险显著下降,AI药企不用像传统生物科技公司那样只聚焦少数靶点,而是能以“平台化”的模式推进研发。星药科技和宇道生物目前正同时积极进行多个项目的研发,旨在通过创新的“制药方法论”实现药物的批量化生产。

此外,在AI制药领域,新研发还造就了一种新的正循环:管线更多,就能产生更多数据,进而在训练模型和优化算法方面更高效;随后,更强的算法造就更强的AI,进而可以高效推进多条管线——某种意义上说,这有些类似链式核裂变反应,一旦越过临界值,就会迎来核爆点。

作者:张懿

编辑:傅璐

*文汇独家稿件,转载请注明出处。

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